The Internet of Things by James Whittaker of Microsoft
IBM与医疗设备制造商Roche ,该公司周四宣布建立一个可以读取人类基因组的低成本设备
虽然该技术可能距离商业化还有十年甚至更长时间,但一旦完成,它应该为每位医生提供一种低成本和快速的方式IBM研究计算生物学高级经理Ajay Royyuru表示:“基因组测序的成本已经下降,速度已经开始提高,但速度,规模仍然存在问题,吞吐量和成本,“Royyuru说,”该项目将使用IBM的“DNA晶体管”。这些晶体管含有纳米孔或非常小的孔,通过其中的每一个可以运行脱氧核糖核酸(DNA)链。纳米孔通过使用电场识别DNA的每个碱基
因为纳米孔部分由硅制成,所以它应该能够通过用于制造微处理器的相同光刻技术大规模生产,从而保持生产“Royyuru说,”虽然其他研究人员也研究过纳米孔的使用,但这种设计不能准确读取DNA,因为DNA在孔中传播得太快
“这就像吸吮意大利面,一旦DNA开始穿过纳米孔,速度非常快,我们已经在10或20毫秒内看到了48,000单位的DNA,以这样的速度,你很少有正确的读数的机会,“Royyuru说。 DNA的速度,IBM已经在纳米孔上制作了一个电子控制器,以将流动速度调整到所需的速度。 “我们可以通过电控制DNA在毛孔中的运动,我们可以逐步推进它”,他说,“虽然DNA测序技术自20世纪70年代初期开始就已出现,但整个人类基因组并没有完整地被解码直到2001年,由于需要解码需要读取的大量碱基对所需的自动机。每个人的DNA含有大约30亿个碱基对的核苷酸。“
年代以来,DNA测序技术得到了改进,但阅读整个人类基因组的成本仍然高达数十万美元,Royyuru说。一旦准备就绪,该设备应该能够在每次读取100美元到1,000美元的范围内完成这项工作,Royyuru估计。
Royyuru拒绝提供该机器将在商业上可用的时间,理由是需要采取许多步骤全新的生产技术。他估计大概需要5到10年的时间才能完成研究。
罗氏的测序子公司454 Life Sciences将最终推出来自该合作的最终产品。 IBM将为合作伙伴带来其在建筑电子和数据管理方面的专业技术,而罗氏将在医学诊断和基因组测序方面应用其知识,Royyuru说。“阅读个人的遗传密码可能有多种医疗效益,Royyuru解释道。他说,最显着的是它将允许医生“提供医疗服务的个性化”。例如,许多药物可以治疗一些人,但不是全部人。掌握一个人的DNA可以帮助医生开出适当的药物。此外,阅读基因组可以揭示对某些疾病的易感性。
也许另一种早期使用可能是确定个体可能生活多久。周四,波士顿大学的研究人员宣布他们已经发现了长寿的遗传特征。
Joab Jackson为
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