“通过这种规模的交易，通常会有很多移动部件，”位于Falls Church的Grad，Logan和Klewans的律师Randall Bowen说，弗吉尼亚州。 “想象一下万花筒，你可以把它转变成一个完美的对称形状，不管发生了什么，一切都落在原地，否则它就会破碎。”<华尔街日报>上周五报道说IBM正在淘金Sun在可能的合并前奏中为潜在的冲突订立了业务合同，预计这一过程“需要几天”。再过了一周，没有任何关于这些公司达成协议的消息，一些观察人士开始怀疑是否存在盗窃行为。“不可能知道他们在看什么，但事实是它需要这么长时间让我们暂停一下，想知道是否有这么多的合同来看待它一直占据着这个位置，还是他们发现了一些他们正忙着追赶的问题，“法律事务所的合伙人史蒂文弗兰克说。 Goodwin Procter
可以肯定的是，这种规模的合并尽职调查过程可能需要几个月才能完成。但是，公司通常会对他们希望获得的业务进行粗略的审查，以宣布初步的合并协议。然后他们需要几个月的时间才能完成交易，以细化细节。如果他们打算合并，Sun和IBM可能只是在讨价还价。但是，如果尽职调查持续不断，那么棘手的知识产权领域可能会产生一些问题，弗兰克说，他总体上谈到了IT行业兼并，而不是专门针对这一点。
两家公司都有大量的产品组合，混合使用开源和商业许可证。他们还与第三方签有许多专利和交叉许可协议，其中包括2004年Sun与微软达成的拜占庭协议，结束了他们之间就Java软件技术提起的诉讼。Sun可能会向第三方授予技术许可例如，这对其产品之一至关重要，而且此类协议有时会有条款规定，如果获得许可证，许可证不得转让。 IBM需要联系第三方来扩展许可证，或者决定是否继续合并，即使它必须找到另一种构建产品的方法。
这是英特尔提出的关于AMD公司销售其制造业务转移至阿布扎比投资集团。英特尔指责AMD违反x86处理器上的一项无法转让给第三方的跨专利协议，并且这些公司正在与调解人进行谈判以解决争议。
冲突的软件许可证也可能是一个问题。许多Sun的产品（包括OpenSolaris，NetBeans和GlassFish Web软件）都使用基于开放源代码Mozilla公共许可证的通用开发和分发许可证。其MySQL数据库是在GPL或Sun商业许可下提供的，而其他产品使用不同的许可证。
根据IBM为Sun的技术计划的内容，混合许可证可能是一项挑战，合作伙伴Randall Colson说。在海恩斯和布恩。例如，一些业内分析人士推测IBM希望将最好的Solaris合并到IBM的AIX Unix中，这是根据IBM商业许可提供的。如果Sun已经将第三方的开源代码合并到Solaris中，IBM可能会发现将Solaris与其专有AIX软件合并的障碍。
对于IBM而言，最复杂的情况可能是Sun与微软达成的复杂协议，微软公司就微软涉嫌企图破坏Java而结束了它们之间的长期诉讼。该交易从微软收购Sun近20亿美元，包括支付Sun公司斥资7亿美元收购Java诉讼，另外9亿美元收购专利共享协议，可能延长10年。 IBM的软件业务在很大程度上依赖于Java，因此需要将这些协议分开，以确保没有任何事情可能会干扰其业务或将其暴露给微软的法律风险。
尽管尽职调查工作仅在一周前就已完成，鲍恩说，假设任何正在进行的谈判遇到麻烦都为时过早。但时间越长，它给客户和投资者带来的不确定性就越大
“可以公平地说，随着每一天的过去，这使得这笔交易似乎不太可能发生，”他说。